Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

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Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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RRN3P1Q2M238 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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RRN3P1Q2M238 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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RRN3P1Q2M238 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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RRN3P1Q2M238 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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RRN3P1Q2M238 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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