Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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