Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DDR2Q16832 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms