Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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DDB1Q16531 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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DDB1Q16531 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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DDB1Q16531 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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DDB1Q16531 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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DDB1Q16531 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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