Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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