Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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LAPTM4AQ15012 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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LAPTM4AQ15012 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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LAPTM4AQ15012 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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LAPTM4AQ15012 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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LAPTM4AQ15012 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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LAPTM4AQ15012 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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LAPTM4AQ15012 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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LAPTM4AQ15012 OSTCP1-202ENST00000522287 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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LAPTM4AQ15012 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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LAPTM4AQ15012 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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LAPTM4AQ15012 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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LAPTM4AQ15012 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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LAPTM4AQ15012 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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