Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IHHQ14623 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IHHQ14623 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IHHQ14623 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IHHQ14623 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IHHQ14623 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IHHQ14623 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IHHQ14623 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IHHQ14623 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms