Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms