Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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