Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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CBX3Q13185 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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CBX3Q13185 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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