Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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