Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LTBQ06643 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LTBQ06643 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LTBQ06643 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LTBQ06643 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LTBQ06643 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LTBQ06643 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LTBQ06643 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LTBQ06643 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LTBQ06643 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LTBQ06643 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTBQ06643 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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LTBQ06643 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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LTBQ06643 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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