Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FDFT1P37268 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FDFT1P37268 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FDFT1P37268 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FDFT1P37268 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FDFT1P37268 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.05■□□□□ 0
FDFT1P37268 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
FDFT1P37268 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FDFT1P37268 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FDFT1P37268 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms