Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HOXC13P31276 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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