Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms