Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms