Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PYGBP11216 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PYGBP11216 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PYGBP11216 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PYGBP11216 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PYGBP11216 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PYGBP11216 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PYGBP11216 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 LYRM7-203ENST00000510516 604 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AP003122.2-201ENST00000527332 486 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PYGBP11216 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PYGBP11216 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PYGBP11216 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PYGBP11216 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PYGBP11216 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PYGBP11216 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PYGBP11216 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PYGBP11216 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PYGBP11216 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PYGBP11216 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PYGBP11216 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PYGBP11216 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PYGBP11216 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PYGBP11216 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PYGBP11216 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PYGBP11216 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PYGBP11216 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PYGBP11216 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PYGBP11216 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PYGBP11216 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PYGBP11216 WFDC5-201ENST00000307971 1034 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PYGBP11216 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PYGBP11216 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PYGBP11216 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PYGBP11216 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PYGBP11216 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PYGBP11216 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms