Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms