Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms