Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPC1L1Q9UHC9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.3 ms