Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms