Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms