Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLDIP3Q9BY77 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
POLDIP3Q9BY77 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
POLDIP3Q9BY77 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
POLDIP3Q9BY77 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
POLDIP3Q9BY77 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
POLDIP3Q9BY77 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.2
POLDIP3Q9BY77 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
POLDIP3Q9BY77 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
POLDIP3Q9BY77 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
POLDIP3Q9BY77 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
POLDIP3Q9BY77 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms