Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms