Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 LINC02139-201ENST00000612023 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC97Q96F63 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms