Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms