Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms