Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRIG3Q6UXM1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms