Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.7 ms