Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL24A1Q17RW2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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COL24A1Q17RW2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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COL24A1Q17RW2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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COL24A1Q17RW2 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL24A1Q17RW2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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