Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms