Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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