Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 RBFOX1-208ENST00000547372 3524 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 GNG7-201ENST00000382159 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ESR1-207ENST00000440973 6466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TRAF3IP2-207ENST00000368761 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 NUTM2B-202ENST00000372321 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC241952.1-201ENST00000612480 6897 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TACC2-229ENST00000515603 9101 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PKP1-201ENST00000263946 5447 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SEC14L2-214ENST00000615189 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CR2-202ENST00000367058 4063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PLEKHG5-208ENST00000400915 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms