Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHPRHQ149N8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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SHPRHQ149N8 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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SHPRHQ149N8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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SHPRHQ149N8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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SHPRHQ149N8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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SHPRHQ149N8 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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SHPRHQ149N8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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SHPRHQ149N8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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SHPRHQ149N8 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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SHPRHQ149N8 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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SHPRHQ149N8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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SHPRHQ149N8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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SHPRHQ149N8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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SHPRHQ149N8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
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