Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms