Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCOF1Q13428 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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