Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CBX3Q13185 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CBX3Q13185 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CBX3Q13185 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CBX3Q13185 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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