Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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