Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PTP4A2Q12974 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PTP4A2Q12974 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PTP4A2Q12974 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PTP4A2Q12974 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PTP4A2Q12974 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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PTP4A2Q12974 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PTP4A2Q12974 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PTP4A2Q12974 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PTP4A2Q12974 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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