Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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FOXO1Q12778 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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FOXO1Q12778 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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FOXO1Q12778 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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FOXO1Q12778 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXO1Q12778 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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