Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms