Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms