Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms