Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms