Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA2P42262 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms