Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms