Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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