Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF40O75150 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF40O75150 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF40O75150 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF40O75150 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF40O75150 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF40O75150 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF40O75150 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF40O75150 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF40O75150 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF40O75150 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF40O75150 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF40O75150 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF40O75150 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF40O75150 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF40O75150 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF40O75150 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF40O75150 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF40O75150 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF40O75150 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF40O75150 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF40O75150 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF40O75150 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF40O75150 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF40O75150 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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