Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AC106788.1-201ENST00000550753 2661 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLGNO14967 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLGNO14967 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLGNO14967 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLGNO14967 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLGNO14967 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLGNO14967 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLGNO14967 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLGNO14967 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLGNO14967 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLGNO14967 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLGNO14967 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLGNO14967 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLGNO14967 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms