Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAB39Q9Y376 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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